Έντονες αντιδράσεις έχει προκαλέσει η απόφαση της Εκτελεστικής Επιτροπής της ΕΠΟ, με την οποία για πρώτη φορά αγνόησε την εισήγηση της Super League, η οποία ζητούσε την κατάργηση της αφαίρεσης βαθμών των ομάδων που δεν θα αδειοδοτηθούν. Ο αναπληρωτής πρόεδρος της Super League, Χρήστος Δάρας, παραιτήθηκε, ενώ εναντίον της απόφασης τοποθετήθηκε και ο ιδιοκτήτης της Λάρισας, Αλέξης Κούγιας.
Οργή στη Super League προκάλεσε η απόφαση της ΕΠΟ να μην κάνει δεκτή την εισήγηση της Λίγκας, για τις ποινές στις ομάδες που δεν καταφέρνουν να αδειοδοτηθούν.
Το διοικητικό συμβούλιο της Super League εισηγήθηκε απαλοιφή της ποινής αφαίρεσης έξι βαθμών, αλλά να παραμείνουν οι μεταγραφικοί περιορισμοί.
Η Εκτελεστική Επιτροπή της ΕΠΟ, ωστόσο, δεν αποδέχθηκε το αποτέλεσμα της ψηφοφορίας στη Λίγκα, για πρώτη φορά στα χρονικά. Θέσπισε ως ποινή για τις μη αδειοδοτημένες ΠΑΕ, την αφαίρεση τριών βαθμών και την απαγόρευση μεταγραφών. Ακολουθώντας τη γραμμή της ΠΑΕ ΠΑΟΚ, κόντρα τόσο στη σύσταση του υπεύθυνου αδειοδότησης της Ομοσπονδίας, όσο και στις οδηγίες της UEFA.
Αυτό προκάλεσε την οργή του αναπληρωτή προέδρου της Super League, Χρήστου Δάρα, ο οποίος μιλώντας στο MEGA, επιβεβαίωσε την παραίτησή του.
«Εγώ θα παραιτηθώ από αναπληρωτής πρόεδρος της Super League. Στις 17:00 αποφασίζουμε, και ο ίδιος ο πρόεδρος μέσα, και 17:30 αναιρούν την απόφαση. Γιατί; Γιατί είναι η κατευθυνόμενη η ΕΠΟ, τι είναι;»
Επίσημη αντίδραση για την απόφαση της ΕΠΟ και από τον ιδιοκτήτη τη ΠΑΕ Λάρισα, Αλέξη Κούγια.
«Ανακοινώνω την παραίτησή μου από το Working Group, αφού άλλωστε καθ’ όλη την διάρκεια της λειτουργίας του δεν λύσαμε, ούτε προσπαθήσαμε να λύσουμε, με αποτελεσματικό τρόπο έστω και ένα θέμα».
Η ΕΠΟ αποφάσισε την οριστική διακοπή της αγωνιστικής δραστηριότητας στη Γ΄ Εθνική και τα ερασιτεχνικά πρωταθλήματα.